马习二会在中国人民大会堂登场，民进党强调台湾前总统马英九的意见无法代表台湾人民；国民党称打破了两岸高度对立的僵局；民众党则认为坚持“九二共识”未获主流民意认同。
民进党周三（10日）表示，是次马英九访中是个人行程，没有代表任何人，马英九的意见也无法代表台湾人民。
民进党强调，和平是两岸双方的共同责任，民进党“承诺不变、善意不变”的态度不会改变， 呼吁中共当局正视两岸互不隶属、台湾主流民意坚持民主自由，以及国际社会重视台海和平稳定的现状，在“对等、尊严”前提下与台湾执政党交流对话，才能开启两岸良性互动新局。
台湾《中央社》报导，民进党立法院党团干事长吴思瑶表示，民进党团乐见两岸对话消弭敌意、促进和平， 不过马英九未能正面呈现台湾主流民意，全然配合并附和中方一中原则下的九二共识，否定台湾主体性，难以让台湾人民认同。
吴思瑶认为，马英九在口误后修正“中华民国”说法，全程以“中华民族”模糊并取代“中华民国”，连自己国家国号都难以说出口，有失中华民国民选总统之高度，令人遗憾。
国民党团则是从地点到会晤内容，全力为马习二会背书。
在会面地点上，国民党团称人民大会堂“东大厅”不只是中国国家主席与外国元首会谈常用场地，更是2005年连胡会（时任国民党主席连战与中共总书记胡锦涛会晤）的地点，突显马英九身为前国家领导人的地位。
国民党团表示，马英九与习近平再次对话，不但开启两岸的和平交流新契机，让中华民国多数民众希望两岸和平交流、共存共荣的声音，被对岸领导人及大陆同胞听到，也让国际社会知道， 台湾社会不是只有抗中、反中一种声音，同时强调，反对台独、不支持台独是国际共识，更是美国、日本等主要国家的具体主张。
民众党新闻稿则表示，无论是官方或民间与中国交流，民众党皆持正面态度。马英九强调两岸民众对于和平繁荣的深刻冀望，的确符合台湾人民期待，因为任何一方对于现状的破坏，将同时对世界和平繁荣造成巨大伤害。
不过民众党认为，马英九提到“坚持九二共识”，这在许多台湾人民眼中，恐怕是落入既定框架，也未获得主流民意认同。
民众党总结会面，认为马英九以个人身分展开交流、为和平努力，有值得肯定之处，然后就抨击台湾陆委会针对马习二会的新闻稿仍是以对抗为主轴，只顾自己政党（民进党）利益、不顾国际动态，难以让人想像这样的陆委会如何在赖清德接任总统之后化解僵局。
